Qarshi davlat universiteti tabiiy fanlar fakulteti zoologiya va fiziologiya kafedrasi

Ketma-ketlikni yig'ish

Ko'pgina DNKlarni sekvensiya qilish usullari to'liq gen yoki genom sekanslarini olish uchun

yig'ilishi   kerak   bo'lgan   ketma-ketlikning   qisqa   qismlarini   ishlab   chiqaradi.  Ov   miltig'ini  

 

 deb

   

nomlangan

 

      ketma-ketligi

 

  texnikasi   (masalan  Genomik   tadqiqotlar   instituti (TIGR)   ,   tomonidan

ishlatilgan   birinchi   bakterial   genomni   ketma-ketlashtirish   uchun, 

Gemofilus   grippi

) ko'p   minglab

kichik DNK bo'laklarining ketma-ketligini hosil qiladi (sekvensiya texnologiyasiga qarab 35 dan 900

gacha nukleotidgacha).  Ushbu qismlarning uchlari bir-biriga to'g'ri keladi  va agar genomni yig'ish

dasturi   to'g'ri   moslashtirilib,   to'liq   genomni   qayta   tiklash   uchun   ishlatilishi   mumkin.   Ov   miltig'ini

ketma-ketligi ketma-ketlik ma'lumotlarini tezda beradi, ammo qismlarni yig'ish vazifasi katta genomlar

uchun juda murakkab bo'lishi mumkin. Katta genom uchun inson genomi, fragmentlarni yig'ish uchun

katta   xotira,   ko'p   protsessorli   kompyuterlarda   ko'p   kunlik   CPU   vaqti   ketishi   mumkin   va   natijada

yig'ilishda keyinchalik to'ldirilishi kerak bo'lgan ko'plab bo'shliqlar mavjud. Ov miltig'ini ketma-ketligi

bugungi   kunda   deyarli   barcha   genomlar   uchun   tanlangan   usu   va   genomni   yig'ish   algoritmlari

bioinformatika tadqiqotlarining muhim yo'nalishi hisoblanadi.