Recommendations for national sars-coV-2 testing strategies and diagnostic capacities

7.

 

Maintenance of essential laboratory services for non-SARS-CoV-2 testing 

Appropriate coordination and management of national resources ensures mitigation of disruption of essential non-SARS-CoV-2 

testing services. Testing strategies for SARS-CoV-2 must promote maintenance of routine diagnostics and minimize disruption to 

the overall health system. Before equipment and resources are redirected towards the COVID-19 response, the impact on 

surveillance and detection of other pathogens, such as HIV, TB, and vaccine preventable diseases (VPD), must be considered. This 

can be achieved by establishing a laboratory contingency plan that aims to mitigate the risk of system breakdown and ensure that 

the laboratory is able to operate effectively and without excessive interruption or delay. Furthermore, a laboratory contingency plan 

allows a laboratory to guarantee that the necessary quality standards will be met in a crisis situation. Relevant information can be 

found in the Laboratory Quality Management (LQMS) training toolkit 

here

. 

GISRS has demonstrated successes in detection of SARS-CoV-2 infections but routine influenza sentinel surveillance must be 

maintained (48). Emergence of influenza strains with pandemic potential remains a possibility and countries must maintain vigilance. 

Trends and co-circulation of SARS-CoV-2, influenza and other respiratory pathogens should be considered in differential diagnosis. 

Multiplex tests are available, but their suitability should be assessed before implementation and they are currently recommended for 

surveillance purposes only. All testing activities for SARS-CoV-2 must consider the existing diagnostic landscape in-country and 

be able to be fully integrated into these other activities, as opposed to creating new mechanisms and parallel systems.