Toshmuxamedova muqaddamning bioinformatika fanidan

---

O’ZBEKISTON RESPUBLIKASI OLIY VA O’RTA 
MAXSUS TA’LIM VAZIRLIGI 
 
MIRZO ULUG’BEK NOMIDAGI 
O’ZBEKISTON MILLIY UNIVERSITETI 
BIOLOGIYA FAKULTETI BIOLOGIYA YO`NALISHI 
4- KURS 2-GURUH TALABASI 
TOSHMUXAMEDOVA MUQADDAMNING 
BIOINFORMATIKA FANIDAN 
 
KURS ISHI 
Mavzu:
DDBJ ma'lumotlar bazasi va uning ahamiyati. 
(DNA Data Bank of Japan) 
TOSHKENT-2022 

---

MUNDARIJA 
1. Kirish. 
2. DDBJ ma'lumotlar. 
3. DDBJ tizimini yangilash. 
4. Ketma-ketlikni tahlil qilish xizmatlari. 
5. Kelajak yo'nalishi. 
6. Moliyalashtirish. 
7. Nukleotidlarning ketma-ketligi bo ’yicha xalqaro ma ’lumotlar bazasini 
yaratish uchun hamkorlik doirasi. 
8. Xulosa. 
9.Foydalanilgan adabiyotlar ro’yxati. 

---

Kirish 
Yaponiya DNK ma'lumotlar banki milliy genetika institutida (NIG) 
tashkil etilgan nukleotid ketma-ketliklarining ommaviy ma'lumotlar bazasi. 
1987dan beri DDBJ an'anaviy ma'lumotlar bazasi xizmati sifatida annotatsiya 
qilingan nukleotid ketma-ketligini to'playdi. Ushbu ish GenBank bilan 
biotexnologiya bo'yicha milliy markazda (NCBI) va Evropa bioinformatika 
institutida (EBI) Evropa nukleotid arxivi ( ENA) bilan hamkorlikda amalga 
oshirildi. Qo'shma struktura xalqaro nukleotid ketma - ketlik ma'lumotlar bazasi 
va ushbu tuzilmadan olingan mahsulotlarning ma'lumotlar bazasi nukleotid 
ketma-ketliklarining xalqaro ma'lumotlar bazasi (INSD) deb ataladi. INSDC 
doirasida DDBJ markazi DDBJ Sequence Read Archive (DRA), BioProject 
loyihasi metadata va Biosampleni keyingi avlod tartiblash platformalaridan 
olingan keng ko'lamli ma'lumotlarni qabul qilishni osonlashtirish uchun 
namunalar haqida ma'lumot olish uchun xizmat qiladi .
Nukleotid ketma-ketliklari va tegishli ma'lumotlarning keng qamrovli 
resursi ma'lumotlar arxivlariga bepul va cheksiz kirishni kafolatlaydigan 
INSDC siyosatiga mos keladi. 2016 da insdc maslahatchilari olimlarni insdc da 
ketma-ketlik ma'lumotlarini taqdim etish zarurligini eslatish uchun ochiq xat 
chop etdi. Bundan tashqari, Ddbj markazi Yapon genotiplari va fenotiplari 
arxiviga xizmat qiladi biologiya fanlari milliy ma'lumotlar bazasi markazi 
Yaponiya fan va texnologiya agentligi.Ushbu ma'lumotlar bazasida 
ma'lumotlarning faqat muayyan tadqiqotlarda foydalanishga ruxsat beruvchi 
kelishuv bitimlarini imzolagan shaxslarning genotipi va fenotipiga oid shaxsiy 
ma'lumotlar saqlanadi. Ma'lumotlarga kirish NCBI da genotiplar va fenotiplar 
ma'lumotlar bazasiga kirish siyosati va EBI da Evropa genom-fenom arxivi 
kabi qat'iy nazorat qilinadi.). NBDC inson tomonidan olingan ma'lumotlar 
almashinuvi bo'yicha qo'llanma va siyosatni taqdim etadi shuningdek, 
ma'lumotlarni yuborish va ulardan foydalanish bo'yicha so'rovlarni ko'rib 

---

chiqadi. NIG tarkibiga kiruvchi ddbj markazi superkompyuter markazi sifatida 
moliyalashtiriladi. Bizning veb-xizmatlarimiz, jumladan, jo'natish tizimlari, 
ma'lumotlarni qidirish tizimlari, veb-API, ddbj annotatsiya o'qish liniyasi va 
server ma'lumotlar bazalari NIG superkompyuter tizimida amalga oshiriladi. 
Joriy tovar klasteri 2012 yilda amalga oshirildi. Ushbu kurs ishida ddbj 
markazida yuqorida ko'rsatilgan xizmatlarni yangilash haqida xabar berilgan. 
Ta'kidlash joizki, hayot fanlari uchun ma'lumotlar bazasi markazi va 
konveyerning izohlarini virtualizatsiya qilish. Bu erda tasvirlangan barcha 
resurslar mavjud http://www.ddbj.nig.ac.jp . va arxiv ma'lumotlarining 
aksariyati quyidagi manzilda yuklab olinishi mumkin ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp .