Funksional genomika

Odamlarda genotiplashni o'rganishning keng tarqalgan kengaytmalaridan biri bu genom bo'ylab assotsiatsiya tadqiqotlari ( GWAS ). Kasalliklar (masalan, revmatoid artritli bemorlar) va nazorat guruhlari (masalan, sog'lom odamlar) namunalari genomning o'ziga xos joylari bo'yicha genotiplanadi, so'ngra bir guruhda (masalan, kasallik holatlarida) sezilarli darajada keng tarqalgan SNPlarni topish uchun statistik tahlil qilinadi. Bunday SNPlar keyinchalik SNPlar va kasallik sezuvchanligi o'rtasidagi bog'liqlikni taklif qilishi mumkin.

• Odamlarda genotiplashni o'rganishning keng tarqalgan kengaytmalaridan biri bu genom bo'ylab assotsiatsiya tadqiqotlari ( GWAS ). Kasalliklar (masalan, revmatoid artritli bemorlar) va nazorat guruhlari (masalan, sog'lom odamlar) namunalari genomning o'ziga xos joylari bo'yicha genotiplanadi, so'ngra bir guruhda (masalan, kasallik holatlarida) sezilarli darajada keng tarqalgan SNPlarni topish uchun statistik tahlil qilinadi. Bunday SNPlar keyinchalik SNPlar va kasallik sezuvchanligi o'rtasidagi bog'liqlikni taklif qilishi mumkin.

Epigenetik profillash

• Epigenetika - bu DNK/xromatinning biokimyoviy modifikatsiyalari yoki fizik o'zaro ta'siri hujayradagi genlarning tartibga solinishiga qanday ta'sir qilishini o'rganadi, bunda bunday modifikatsiyalar/o'zaro ta'sirlar asosiy DNK ketma-ketligidagi o'zgarishlar bilan bog'liq emas.
• DNK darajasida CpG dinukleotidlarining metillanishi (ko'pincha gen promotorlari yaqinida joylashgan) birinchi navbatda metillanmagan sitozinlarni bisulfit yordamida urasilga aylantirish orqali aniqlanishi mumkin, bu esa metillangan va metillanmagan sitozinlarni ajratish imkonini beradi.
• Xromatin darajasida giston oqsillari dumlarining modifikatsiyalari (masalan, metillanish, atsetillanish) xromatin va oqsillar teskari tarzda kimyoviy o'zaro bog'langan "immunopresipitatsiya" orqali xaritada ko'rsatilishi mumkin. Qiziqarli modifikatsiya/oqsil bilan bog'liq genomik DNK keyinchalik modifikatsiya/oqsilga qarshi ko'tarilgan maxsus antikorlar bilan "pastga tortiladi" (cho'kadi). Presipitatsiyadan so'ng, keyingi tahlil qilish uchun genomik DNKni chiqarish uchun o'zaro bog'lanish qaytariladi.