Bog'liq Hosilbekov Jasurbek va Umirzakov Samandarning Genomika fanidan tayyorlagan mustaqil ishi
Bundan farqli o'laroq, ildizsiz daraxt kirish ketma-ketligi orasidagi masofalar va munosabatlarni kelib chiqishi haqida hech qanday taxminlarsiz chizadi. Ildizsiz daraxt har doim ildizi bo'lgan daraxtdan yaratilishi mumkin, ammo divergentsiya haqida qo'shimcha ma'lumotlarsiz, masalan, molekulyar soat gipotezasi farazisiz, odatda ildizsiz daraxtga ildiz qo'yish mumkin emas. [uch]
Bundan farqli o'laroq, ildizsiz daraxt kirish ketma-ketligi orasidagi masofalar va munosabatlarni kelib chiqishi haqida hech qanday taxminlarsiz chizadi. Ildizsiz daraxt har doim ildizi bo'lgan daraxtdan yaratilishi mumkin, ammo divergentsiya haqida qo'shimcha ma'lumotlarsiz, masalan, molekulyar soat gipotezasi farazisiz, odatda ildizsiz daraxtga ildiz qo'yish mumkin emas. [uch]
Kirish ketma-ketliklarining ma'lum bir guruhi uchun barcha mumkin bo'lgan filogenetik daraxtlar to'plamini optimallashtirish algoritmi orqali qidirish yo'lini kuzatish mumkin bo'lgan diskret belgilangan ko'p o'lchovli "daraxt maydoni" sifatida kontseptsiyalash mumkin. Kirish ketma-ketliklarining arzimas soni uchun daraxtlarning umumiy sonini hisoblash daraxt topologiyasi taʼrifidagi oʻzgarishlar tufayli murakkablashishi mumkin, ammo maʼlum miqdordagi kirishlar va parametrlarni tanlash uchun ildizi boʻlmagan daraxtlardan koʻra koʻproq ildizli daraxtlarga ega boʻlish Bu har doim toʻgʻri ekanligini anglatadi. Ildizli va ildizsiz filogenetik daraxtlarni ildizli va ildizsiz filogenetik tarmoqlarga umumlashtirish mumkin, bu esa evolyutsiya hodisalarini, masalan, duragaylash yoki gorizontal genlarni o'tkazishni modellashtirish imkonini beradi.
Kirish ketma-ketliklarining ma'lum bir guruhi uchun barcha mumkin bo'lgan filogenetik daraxtlar to'plamini optimallashtirish algoritmi orqali qidirish yo'lini kuzatish mumkin bo'lgan diskret belgilangan ko'p o'lchovli "daraxt maydoni" sifatida kontseptsiyalash mumkin. Kirish ketma-ketliklarining arzimas soni uchun daraxtlarning umumiy sonini hisoblash daraxt topologiyasi taʼrifidagi oʻzgarishlar tufayli murakkablashishi mumkin, ammo maʼlum miqdordagi kirishlar va parametrlarni tanlash uchun ildizi boʻlmagan daraxtlardan koʻra koʻproq ildizli daraxtlarga ega boʻlish Bu har doim toʻgʻri ekanligini anglatadi. Ildizli va ildizsiz filogenetik daraxtlarni ildizli va ildizsiz filogenetik tarmoqlarga umumlashtirish mumkin, bu esa evolyutsiya hodisalarini, masalan, duragaylash yoki gorizontal genlarni o'tkazishni modellashtirish imkonini beradi.