Odamidur ilmu donish birla odam, yôq esa, Odamidur ilmu donish birla odam, yôq esa

Ushbu turkumning asosiy maqolasi: Filogeniyadagi masofa matritsalari. Filogenetik tahlilning masofaviy matritsa usuli aniq tasniflanayotgan ketma-ketliklar orasidagi "genetik masofani" o'lchashga tayanadi va shuning uchun MSA ni kiritish sifatida talab qiladi. Masofa ko'pincha tekislangan pozitsiyalardagi nomuvofiqliklar nisbati sifatida aniqlanadi va intervallar e'tiborga olinmaydi yoki nomuvofiqlik sifatida hisoblanadi. Masofa usuli har bir ketma-ketlik juftligi orasidagi masofani tavsiflovchi ketma-ketlik soʻrovlari toʻplamidan yaxlit matritsani qurishga harakat qiladi. Bundan bir xil ichki tugun ostiga bir-biriga yaqin turuvchi ketma-ketliklarni joylashtirgan filogenetik daraxt quriladi.Shox uzunliklari ketma-ketliklar orasidagi kuzatilgan masofalarni yaqindan takrorlaydi. Masofaviy matritsa usuli hisobda ishlatiladigan algoritmga qarab, ildizli yoki ildizsiz daraxtni hosil qilishi mumkin. Ular ko'pincha ko'p ketma-ketlikni tekislashning progressiv va iterativ turlari uchun asos sifatida ishlatiladi. Masofaviy matritsa usulining asosiy kamchiligi shundaki, u bir nechta pastki daraxtlarni qamrab olgan mahalliy yuqori o'zgaruvchanlik mintaqalari haqidagi ma'lumotlardan samarali foydalanmaydi.

• Ushbu turkumning asosiy maqolasi: Filogeniyadagi masofa matritsalari. Filogenetik tahlilning masofaviy matritsa usuli aniq tasniflanayotgan ketma-ketliklar orasidagi "genetik masofani" o'lchashga tayanadi va shuning uchun MSA ni kiritish sifatida talab qiladi. Masofa ko'pincha tekislangan pozitsiyalardagi nomuvofiqliklar nisbati sifatida aniqlanadi va intervallar e'tiborga olinmaydi yoki nomuvofiqlik sifatida hisoblanadi. Masofa usuli har bir ketma-ketlik juftligi orasidagi masofani tavsiflovchi ketma-ketlik soʻrovlari toʻplamidan yaxlit matritsani qurishga harakat qiladi. Bundan bir xil ichki tugun ostiga bir-biriga yaqin turuvchi ketma-ketliklarni joylashtirgan filogenetik daraxt quriladi.Shox uzunliklari ketma-ketliklar orasidagi kuzatilgan masofalarni yaqindan takrorlaydi. Masofaviy matritsa usuli hisobda ishlatiladigan algoritmga qarab, ildizli yoki ildizsiz daraxtni hosil qilishi mumkin. Ular ko'pincha ko'p ketma-ketlikni tekislashning progressiv va iterativ turlari uchun asos sifatida ishlatiladi. Masofaviy matritsa usulining asosiy kamchiligi shundaki, u bir nechta pastki daraxtlarni qamrab olgan mahalliy yuqori o'zgaruvchanlik mintaqalari haqidagi ma'lumotlardan samarali foydalanmaydi.